Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms