Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ME1P48163 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ME1P48163 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms