Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms