Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MARCKSP29966 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms