Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAG9O60271 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms