Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC9O14530 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms