Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms