Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM2AQ9Y2K7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms