Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTF2Q9UNY4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms