Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGC1AQ9UBK2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms