Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ASCL3Q9NQ33 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ASCL3Q9NQ33 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ASCL3Q9NQ33 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ASCL3Q9NQ33 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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