Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms