Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIFKQ9BYG3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms