Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms