Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C9orf16Q9BUW7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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C9orf16Q9BUW7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf16Q9BUW7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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