Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRBNQ96SW2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms