Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGAP1Q96PV0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms