Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms