Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF496Q96IT1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms