Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PELI3Q8N2H9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms