Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms