Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms