Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC27A3Q5K4L6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms