Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ANKRD39Q53RE8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms