Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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