Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms