Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms