Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms