Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms