Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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