Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF5Q13568 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms