Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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