Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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AP3B2Q13367 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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AP3B2Q13367 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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AP3B2Q13367 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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