Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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