Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFRD2Q12894 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms