Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms