Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms