Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms