Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms