Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA8P53708 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms