Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMSP52788 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMSP52788 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMSP52788 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms