Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms