Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms