Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MLH1P40692 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MLH1P40692 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MLH1P40692 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MLH1P40692 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MLH1P40692 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MLH1P40692 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MLH1P40692 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MLH1P40692 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MLH1P40692 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MLH1P40692 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms