Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBRP36941 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms