Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF1P10914 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF1P10914 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF1P10914 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms