Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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