Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERPINA1P01009 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms