Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF13O43567 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF13O43567 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF13O43567 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF13O43567 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF13O43567 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF13O43567 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF13O43567 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RNF13O43567 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF13O43567 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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