Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHF1O43189 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PHF1O43189 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PHF1O43189 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PHF1O43189 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PHF1O43189 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PHF1O43189 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PHF1O43189 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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